人工魚礁投放後，灰暗的礁體如何漸漸形塑成嶄新的魚族龍宮呢？首先，依循著動物追逐食物而遷徙的特性，人工魚礁必得先成為食源豐盛的餌料場。
礁體下沉後，改變了海底的地形，並藉著海流、波浪等作用攪動海底的營養鹽，增強浮游生物的繁殖能力。
此外，礁體廣大的表面積成為藻類、珊瑚群與軟體動物絕佳的附著生長地，藻類隨著海浪招惹魚群到來，眾多與珊瑚共生的海洋生物也跟著落居，新的人工魚礁生態體系逐漸成型。
由漁業署委託學術單位所進行的調查中，發現各個礁體的空間與表面積均有適當的成效，其表層已經長滿自營性生活之藻類及初級或次級消費者，礁體上層吸引洄游性魚類悠遊其中，中底層棲息著石斑類與鯛類等定著性魚種。

在人工魚礁投放到海底的初期，平滑的表面先由藻類與藤壺、牡蠣等附著於其上，它們是創造全新棲息環境的先驅，之後其它固著性的海洋生物才會跟著固著生長，如：海膽、水螅、海綿、海蛞蝓等腔腸動物與無脊椎動物。這些生物就有如海中精靈，率先啟動了這場生命的盛宴。
藤壺是最早附著於人工魚礁上的生物，此後，其他固著性生物才能藉此著力繁殖。
而水螅和海綿因為不容易移動身體，常吸附於海底或者和其他生物形成共生的關係，它們可分泌毒液協助禦敵。